La tuberculosis es una enfermedad infecciosa con alta mortalidad a nivel global, considerándose un problema de salud pública. La dificultad para su diagnóstico, sobre todo en países de bajos y medianos ingresos limitan su erradicación. El Xpert MTB/RIF es una herramienta molecular que provee un diagnóstico rápido e informa sobre la presencia de cepas resistentes a la rifampicina, permitiendo iniciar un tratamiento de forma rápida y eficaz. Sin embargo, tiene problemas para el diagnóstico de casos paucibacilares y se han reportado falsos positivos respecto a la resistencia a rifampicina y en pacientes con antecedente de tuberculosis. Por esto, aparece el Xpert MTB/RIF Ultra, mostrando mejor sensibilidad para el diagnóstico de la tuberculosis, sobre todo en casos paucibacilares, y disminución de falsos positivos para resistencia a rifampicina; siendo la prueba molecular más recomendada por la OMS. Teniendo en cuenta lo anterior, se espera que mejore el diagnóstico de la enfermedad, dando la oportunidad de iniciar el tratamiento de forma oportuna.
En este artículo de revisión se evaluarán retos por mejorar en el diagnóstico de la tuberculosis, características y rendimiento del Xpert MTB/RIF y  Xpert MTB/RIF Ultra para formas pulmonares y extrapulmonares y para la detección de la resistencia a la rifampicina.